Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX10Q9Y5X0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX10Q9Y5X0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312 ms