Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD2APQ9Y5K6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD2APQ9Y5K6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD2APQ9Y5K6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD2APQ9Y5K6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CD2APQ9Y5K6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CD2APQ9Y5K6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD2APQ9Y5K6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD2APQ9Y5K6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD2APQ9Y5K6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD2APQ9Y5K6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD2APQ9Y5K6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD2APQ9Y5K6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms