Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E2

PCDHB7, Protocadherin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB7Q9Y5E2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB7Q9Y5E2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB7Q9Y5E2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB7Q9Y5E2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB7Q9Y5E2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB7Q9Y5E2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB7Q9Y5E2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB7Q9Y5E2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB7Q9Y5E2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms