Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKAB1Q9Y478 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms