Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMED3Q9Y3Q3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED3Q9Y3Q3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms