Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRELID3BQ9Y3B1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRELID3BQ9Y3B1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms