Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP3Q9Y2W7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms