Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BTRCQ9Y297 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BTRCQ9Y297 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms