Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC4Q9Y296 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC4Q9Y296 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms