Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINS2Q9Y248 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GINS2Q9Y248 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINS2Q9Y248 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINS2Q9Y248 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINS2Q9Y248 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINS2Q9Y248 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINS2Q9Y248 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINS2Q9Y248 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINS2Q9Y248 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINS2Q9Y248 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms