Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NOD1Q9Y239 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms