Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNEQ9Y223 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms