Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HHLA3Q9XRX5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms