Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPS5Q9UPZ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms