Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGAP1Q9UPQ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms