Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF18Q9UNG2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF18Q9UNG2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms