Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP18Q9UMW8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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