Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PADI3Q9ULW8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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