Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNRF3Q9ULT6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms