Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZNF608Q9ULD9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZNF608Q9ULD9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms