Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB23Q9ULC3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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RAB23Q9ULC3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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RAB23Q9ULC3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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RAB23Q9ULC3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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RAB23Q9ULC3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RAB23Q9ULC3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RAB23Q9ULC3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RAB23Q9ULC3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RAB23Q9ULC3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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RAB23Q9ULC3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB23Q9ULC3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB23Q9ULC3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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