Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms