Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C4Q9UKN8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms