Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPUSD1Q9UJJ7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms