Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX4Q9UIU6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms