Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCOCQ9UIL1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms