Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNTNAP2Q9UHC6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP2Q9UHC6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms