Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASIC3Q9UHC3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC3Q9UHC3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms