Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms