Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms