Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms