Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CGNQ9P2M7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms