Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RCOR3Q9P2K3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCOR3Q9P2K3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms