Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRBP1Q9P2E9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRBP1Q9P2E9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms