Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH10Q9P2E7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms