Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGFRNQ9P2B2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGFRNQ9P2B2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms