Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP36Q9P275 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP36Q9P275 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms