Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN3Q9P232 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms