Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXXC1Q9P0U4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXXC1Q9P0U4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms