Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SENP1Q9P0U3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms