Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GGA3Q9NZ52 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GGA3Q9NZ52 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms