Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKIRAS2Q9NYR9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms