Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP4R2Q9NY27 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms