Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms