Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDIT4Q9NX09 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms