Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FANCLQ9NW38 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms