Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms