Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC6A13Q9NSD5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms