Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms