Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms